Laden van de dynastie van de Stuarts, bouwden grote kastelen en paleizen in Stirling, Falkland, Linlithgow en Edinburgh. De beroemdste Stuart was de Schotse koningin Mary. Ze verbleef in vele steden tijdens haar rondritten door Schotland. Ze logeerde in kastelen en religieuze centra van Balvenie Castle in het noorden tot Whithorn Priory in Galloway in het zuiden. Mary's zoon, Koning James VI van Schotland, werd James I van Engeland na de 'Union of the Crowns' in 1603. De 17e eeuw werd gekenmerkt door religieuze conflicten, die resulteerden in de verbanning van de Stuarts en de opstand van hun navolgelingen, de jakobieten.
Zijn achterachterkleinzoon, prins Charles Edward Stuart, die in ballingschap in Italië werd geboren, beschouwde zichzelf als de rechtmatige koning. In 1745 landde hij in Eriskay in de Buiten-Hebriden. Hierna begon een serie gebeurtenissen die de Highlands voor altijd zouden veranderen. Zijn campagne eindigde in 1746 op het slagveld van Culloden, bij Inverness, waar de troepen van de regering de jakobieten versloegen. Dit was de laatste oorlog dat Britse bodem is uitgevochten. Het is een van de meest indrukwekkende slagvelden van Groot-Brittannië en u kunt het bezoeken in het Culloden Visitor Centre, dat nu door de National Trust for Scotland wordt beheerd.